《民雄鬼屋》的剧情发生在台湾嘉义的一个古老宅邸。清明时节，单亲妈妈何圣心带着女儿小琪和年迈的母亲来到民雄公墓扫墓。在扫墓过程中，小琪不慎误触了一个邪阵，随后神秘失踪。

心急如焚的何圣心和母亲回到那座据说曾发生过多起灵异事件的何宅，希望找到小琪的踪迹。然而，她们发现原本被长期封禁的三楼已被打开，何圣心在房间内遭遇了邪灵的纠缠。

与此同时，小琪的好友阿智也来到何宅寻找她。两人在寻找过程中意外进入了一个与何宅完全相同但方向颠倒的异度空间。在这个空间里，他们遭遇了一系列不可思议的恐怖事件，并逐渐被引导至庭院中的一口古井旁。

随着故事的深入，一个埋藏多年的恐怖秘密逐渐浮出水面，而所有这一切都与那座民雄鬼屋紧密相连。