《原以为命中注定的恋爱不会发生在我身上》的剧情深入描绘了主角白野莉子的内心世界和她与黑川壮一郎的意外邂逅。莉子是一个沉浸在恋爱养成游戏设计中的女性，她的生活充满了对理想爱情的幻想，但对现实中的恋爱却充满了失望。当APP公司的社长黑川壮一郎找到她，希望她制作一款手机恋爱游戏时，她看到了一个将幻想变为现实的机会。

在合作过程中，莉子发现壮一郎虽然外表出众，但对女性的心思却一无所知。两人因此产生了不少争执，却也在这过程中慢慢靠近。壮一郎一直暗恋着他的下属桃濑，莉子则成为了他的“恋爱指导”。然而，随着两人关系的深入，莉子发现自己对壮一郎的感情也在悄然变化，她意识到，原来自己可能早已爱上了这个不懂女人心的男人。