《诊疗中第二季》的剧情围绕着几位心理医生的生活与工作展开。吉米，一位非传统的心理治疗师，在无视传统训练与道德束缚的同时，采用大胆且真诚的方式与患者交流，帮助他们跨越生活的障碍与苦楚。然而，他的行为也悄然引发了周遭人生活的巨变，包括他自己。吉米在处理个人心理波动与挑战的同时，职业生涯也在不断成长。

保罗，另一名心理医生，由哈里森·福特饰演，他一边处理因帕金森症引起的焦虑，一边试图教导吉米学会设立界限的重要性，并在这个过程中学会了向别人敞开心扉。吉米和保罗之间的较量既有趣又富有深意，两人共同展示了在治愈别人的过程中自己也被治愈的故事。

此外，剧中还涉及了其他心理医生如加比等人的故事，他们各自面对生活的困境，学会放手，以真心和幽默对待心理治疗与患者，展现了心理咨询行业的真实面貌与变化。