《万界超市》的剧情设定在一个独特的超市之中，这家超市不仅售卖日常商品，还连接着万千世界的奇异通道。主人公李明，一个平凡的超市员工，意外发现超市的隐藏功能。每当夜晚降临，超市的货架会变换成通往不同世界的门户。

李明通过这些门户，遇见了来自各个世界的客人，有来自古代的英雄，也有来自未来的科学家，甚至还有来自神话传说中的神祇。他与这些客人交流，了解他们的文化和故事，同时也帮助他们解决在现实世界中的困境。

然而，随着越来越多的客人出现，超市的秩序开始混乱，李明也面临着前所未有的挑战。他必须学会平衡现实与奇幻，找到维持超市正常运转的方法。在这个过程中，李明不仅收获了友情和成长，还发现了自己真正的使命和价值。