《海鸥乔纳森》这部电影描绘了一只与众不同的海鸥乔纳森的成长历程。乔纳森天生热爱飞翔，它不愿像其他海鸥一样满足于简单的觅食生活，而是追求着更高、更快的飞行技巧。在不断地尝试与探索中，乔纳森遭受了来自族群的排斥与嘲笑，甚至一度被流放。

然而，乔纳森并未放弃自己的梦想。它独自在远方练习飞行，不断地挑战自己的极限。在这个过程中，它发现了许多飞行的新境界，也结识了志同道合的伙伴。他们一起探索、学习，最终创造出一套全新的飞行技巧。

电影的高潮部分，乔纳森与伙伴们回到原来的族群，用他们的飞行技巧展示了飞翔的真正意义。虽然一开始遭遇了误解与抵抗，但最终他们的精神感染了整个族群，海鸥们开始追求更高的飞翔梦想。电影以乔纳森与族群一起翱翔在天空的壮观画面作为结尾，寓意着追求梦想与自我超越的永恒主题。